ٹی ڈی-5000ایکس رے سنگل کرسٹل ڈفریکٹومیٹربنیادی طور پر غیر نامیاتی، نامیاتی اور دھاتی کمپلیکس جیسے کرسٹل لائن کے تین جہتی مقامی ڈھانچے اور الیکٹران کلاؤڈ کثافت کا تعین کرنے کے لیے استعمال کیا جاتا ہے، اور خاص مواد جیسے جڑواں، غیر موافق کرسٹل، کواسکرسٹلز وغیرہ کی ساخت کا تجزیہ کرنے کے لیے۔ درست تین جہتی جگہ (بشمول بانڈ کی لمبائی، بانڈ زاویہ، نئے مرکب (کرسٹل لائن) مالیکیولز کی ترتیب، تشکیل، اور یہاں تک کہ بانڈنگ الیکٹران کثافت) اور جالی میں مالیکیولز کی اصل ترتیب؛ یہ کرسٹل سیل کے پیرامیٹرز، خلائی گروپ، کرسٹل مالیکیولر ڈھانچہ، بین مالیکیولر ہائیڈروجن بانڈنگ اور کمزور تعاملات کے ساتھ ساتھ مالیکیولر کنفیگریشن اور کنفارمیشن جیسی ساختی معلومات فراہم کر سکتا ہے۔ یہ کیمیائی کرسٹالوگرافی، سالماتی حیاتیات، فارماسولوجی، معدنیات، اور مواد سائنس میں تجزیاتی تحقیق میں وسیع پیمانے پر استعمال ہوتا ہے۔