ایکس رے سنگل کرسٹل ڈفریکٹومیٹر بنیادی طور پر کرسٹل لائن مادوں جیسے غیر نامیاتی، نامیاتی اور دھاتی کمپلیکس کے تین جہتی مقامی ڈھانچے اور الیکٹران کلاؤڈ کثافت کا تعین کرنے اور خصوصی مواد جیسے جڑواں، غیر موافق کرسٹل کی ساخت کا تجزیہ کرنے کے لیے استعمال کیا جاتا ہے۔ quasicrystals، وغیرہ

نئے مرکب (کرسٹل لائن) مالیکیولز کی درست سہ جہتی جگہ (بشمول بانڈ کی لمبائی، بانڈ اینگل، کنفیگریشن، کنفارمیشن، اور یہاں تک کہ بانڈنگ الیکٹران کثافت) اور جالی میں مالیکیولز کی اصل ترتیب کا تعین کریں۔ یہ کرسٹل سیل کے پیرامیٹرز، خلائی گروپ، کرسٹل مالیکیولر ڈھانچہ، بین مالیکیولر ہائیڈروجن بانڈنگ اور کمزور تعاملات کے ساتھ ساتھ مالیکیولر کنفیگریشن اور کنفارمیشن جیسی ساختی معلومات فراہم کر سکتا ہے۔ یہ وسیع پیمانے پر کیمیائی کرسٹالوگرافی، سالماتی حیاتیات، فارماسولوجی، معدنیات، اور مواد سائنس میں تجزیاتی تحقیق میں استعمال ہوتا ہے۔